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CHINOOK

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by

erher 998798

on 30 October 2013

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Transcript of CHINOOK

CHINOOK
¿QUE ES BIOINFORMATICA?
-Bioinformatica: tecnología de computadores aplicada a la gestión y análisis de datos biológicos.

-Chinook es una aplicación bioinformática especializada en genómica.

-Se usan protocolos P2P para favorecer la investigación bioinformática.

JXTA
-Plataforma P2P, open source.

-Creada por Sun Microsystems en el año 2001.

-Es un conjunto de protocolos basados en XML.

-Conecta dispositivos independientemente de la topología de la red.
CONTINUACION JXTA
-Es el framework P2P más maduro.

-Conecta diferentes dispositivos de forma descentralizada.

-Crea una red virtual que conecta a los pares a pesar de diversos obstáculos.

-Identifica a cada par unívocamente con un ID único (URN SHA-1).

¿COMO TRABAJA CHINOOK?
-Transforma aplicaciones de línea de comandos en servicios.

-Estos servicios se transmiten a través de la red virtual.

-Más de 25 servicios de análisis.

-Resulta fácil añadir nuevos servicios.

CHINOOK
-Servicio P2P de bioinformática que utiliza JXTA.

-Objetivo: facilitar el intercambio de técnicas de análisis de genoma.

-Acceso a través de servicios Perl, Java o aplicaciones como Sockeye.

-Su licencia es LGPL (Licencia Pública GNU).
CHINOOK ARCHITECTURE
CHINOOK VS BOINC
-Paradigma P2P frente a Cliente-Servidor

-BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), nacido en Berkeley en 2002

-Paradigma Cliente-Servidor para red de computación distribuida



CHINOOK VS BOINC II
-BOINC tambien tiene Licencia LGPL

-Más de 590.000 hosts

-Capacidad media de 9.2 petaFLOPS

-Proyectos de física, medicina,
genética, climatología,
astrofísica...

-Actualmente no dispone de soporte

-Desde 2005 no se actualiza
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