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Copy of Academy: Inserting Animations in Prezi

Best practices on how to use simple flash animations in combination with prezi Path and Frames - to achieve a strong narrative.
by

Jose Garmendia

on 3 May 2010

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Transcript of Copy of Academy: Inserting Animations in Prezi

...and don't forget:
there is a lot to
explore in Prezi so be on the
lookout for
new ideas! Hipótesis:
Por: José Garmendia Rodríguez
Elisamar Rivera Para:
Seminario de Micro del Agua
Profesor: José Arbelo.
Universidad de Puerto Rico en Arecibo
Departamento de Biología
Seminario Micro del Agua.

Objetivos:

Conocer acerca de la biorremediación.

Explicar el papel que juegan las bacterias marinas en los derrames de petróleo.

Identificar el potencial de la Alcanivorax sp. cepa 2B5 para el uso en la biorremediación.

Comprobar que la Alcanivorax sp. 2B5 tiene la capacidad de degradar el octadecano.


Introducción:

El petróleo es una mezcla compleja de miles de componentes, predominantemente de hidrocarburos, entre ellos los N-alcanos. La economía mundial depende casi totalmente de este y sus derivados como fuente de energía y materia prima para una vasta suma de productos. Como consecuencia, más de 3.5 billones de toneladas del crudo son extraídas anualmente y alrededor del 0.1% de este es derramado en las aguas continentales e intercontinentales durante su extracción, transportación y consumo del crudo y sus derivados. Estos eventos inaceptables para el ambiente acuático podrían ser solucionados utilizando la biorremediación.
Vías mediante las cuales el petróleo derramado entra
en el ecosistema marino. Figura #1 Tomada de: Long-term Environmental Impact, Centre for Marine Biodiversity and Biotechnology, Department of Biological Sciences, Heriot-Watt University, Riccarton, Edinburgh EH14 4AS, Scotland, UKf Oil Spills. Impacto de los derrames de petróleo en los ecosistemas marinos. Se afectan también las comunidades de animales como los pájaros y peces.
Se afectan el fitoplankton, zooplankton y el bacterioplankton.
Las comunidades bénticas desaparecen.
Contaminación del DOM que es utilizado por los microorganismos para su nutrición.
Se afectan las biopelículas, los tapetes microbianos, etc.

Algunos ejemplos de derrames de petróleo.


Exxon Valdéz: Alaska, 1989. derrame 41,000 m3


Amaco Cadiz: Costa de francia, 1999. 223 000 toneladas de petróleo se derramaron.


Sea Empress: Costa de Wales, 1996, se derramó alrededor de 72000 toneladas del crudo.




Fig. # 2 Foto de una ballena muerta debido a la contaminación producida en la costa por el derrame de Exxon Valdéz.
¿ Cómo resolver el problema de una forma ecológicamente amigable ?
Existen varias técnicas para contrarrestar los derrames, estas son nocivas al ambiente y la ecología.

Microorganismos que han evolucionado para degradar naturalmente los compuestos del petróleo.

Biodegradación.

Algunas bacterias marinas que poseen la capacidad de degradar el petróleo. Conocemos alrededor de 160 géneros aislados con esta capacidad.

Muchos de ellos son heterótrofos perteneciente a las Proteobacterias: Pseudomonas sp., Acinetobacter sp., Cycloclasticus sp. y Alcanivorax sp.

Biorremediación.
Bacterias Marinas que degradan los hidrocarburos del petróleo. g-Proteobacteria
G+ bacteria
Alcanivorax sp.

Cycloclasticus sp.

Oleiphilus sp.

Oleispira sp.
Planococcus sp.
LMW PAHs:
Naphthalene,
Phenanthrene
Anthracene
Fig. 2. Ejemplos de algunas bacterias que son capaces de degradar los compuestos ciclicos del petróleo.
Alcanivorax sp. Varios estudios demuestran la capacidad para degradar petróleo en ambiente marinos (HCB).

No sólo consumen los hidrocarburos de petróleo como única fuente de carbono pero también producen un lipo-surfactante.
Biosurfactantes producidos por Alcanivorax sp. Biosurfactante producido por Alcanivorax sp. Es un glucolípido que existe en 2 formas Adherido a la superficie celular (contiene glicerina).
Libre en el espacio extracelular (no contiene glicerina).
Promueve el carácter hidrofóbico y afinidad por las gotas de aceite.
Promueve la formación de gotas de agua-aceite emulsificadas Titulo: Biorremediación de hidrocarburos en sistemas oceánicos utilizando la bacteria Alcanivorax spp.
¿ Cuál es la enzima responsable de la degradación de los hidrocarburos en la bacteria?
Alcanohidroxilasa: se compone
de 3 monooxigenasas.
Rubredoxina reductasa (proteína libre en citoplasma)
Hidroxilasa (proteína de la membrana)
Rubredroxina (proteína libre en el citoplasma)
Reacción Global: R-H+ O2 + NADH + H+ R-OH + H2O + NAD+
Esquema 2. Complejo enzimático responsable por la degradación de los hidrocarburos en las Alcanivorax sp.
Materiales y Metodología:

Cepas Medios Plásmidos
Cepas E.coli DH5
P.FLourecens KOB21 MSM
LB
HLB
pCOM8
pM1D19-T
Químicos y enzimas: Alcanos:
Octadecano
Fenantreno n-hexano (separador
de la fase orgánica) Aislamiento e Identificación de la cepa degradadora
de alcanos. Fango de mar contaminado con petróleo -Donghai, China.
Dilución en serie.
Platos MSM con octadecano.
Bergey’s Manual.
Analisis filogenético.





Un puerco con alas??? Comó se determinó que la cepa 2B5 degradaba petróleo? Cepa
2B5 Medio HLB Medio MSM Inóculo +
Octadecano 5 Dias @ 30 grados. 50mL 50 mL 15 dias @ 30grados celc. Medio MSM Inóculo+ NO Octadecano. Nota: Se realizó un analisis GC/MS para determinar que el crudo
había desaparecido en el medio pasados los 15 dias de incubación. Se realizaron 3 experimentos para comprobar la capacidad de la Alcanivorax sp. de degradar petróleo. Expresión del partrón del gen
alkB. Fue expresado en el medio que
contenia octadecano (MSM). No se expresó en el medio que no poseía alcano(HLB). Nota: el gen alkB es el que contiene la información
para la síntesis de enzimas que degradan el petróleo
en algunas de las bacterias marinas como las
Marinobacter spp. y las Pseudomonas spp. Para determinar la expresión funcional del gen alkB.
Se queria demostrar que el gen expresaba enzimas capaces de degradar alcanos de cadenas de 12 a 28 carbonos. Se utilizó la P. Fluorescens K0B21
(posee una delición para degradar
Cabonos (12-16)). Se amplificó el gen alkB de la 2B5, luego
se inserta en el pCom8, y se transforma
a P. Fluorescens. Ahora P. Fluorescens
puede degradar alcanos
(12-28) Se puso en un medio
e-2 suplementado con
n-alcanos (12-16). Discusión de los resultados:
Tipo de Bacteria coccus, Gram negativo Temperatura, pH
y salinidad óptimos. 30-37 grados, 6-7 y altas concentraciones de NaCl, respectivamente. Pruebas Bioquímicas. + oxidasa/- a fermentación de glucosa, rojo metilo, Vogues-Proskauer y Reductasa de nitrato. Utilización de petróleo
como única fuente de
carbono. Posee la capacidad de sobrevivir en este ambiente. http://cnn.com/video/?/video/us/2010/04/26/tsr.phoenix.mayor.to.sue.arizona.cnn Se encontró una cepa marina desconocida, la cual se aisló e identificó como Alcanivorax sp. cepa2B5.Su semejanza con otras bacterias que degradan los hidrocarburos de petróleo fue determinada, por lo tanto, esta bacteria debe ser HCB.
Si dicha cepa posee la capacidad de degradar el octadecano provisto en el medio de cultivo
como única fuente de carbono, entonces posee un gen que codifica para la enzima encargada
de esta reacción de degradación de alcanos de cadenas relativamente largas y además pudiera ser recomendada como herramienta biológica en la biorremediación de derrames de petroleo en sistemas marinos.
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