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Transcript

TD8 Le modèle de Hardy-Weinberg : un équilibre théorique

Sources : Belin, Bordas,

P. Cosentino

Problématique

Grâce aux travaux de Mendel au XIXe siècle, on a compris que la transmission des caractères

héréditaires se fait par les gènes, existant sous différentes versions appelées allèles.

Objectif :

Extraire, organiser, exploiter des informations sur l’évolution des fréquences alléliques dans des populations

Au sein d’une espèce, dans les différentes populations, les allèles des gènes sont transmis de génération en génération selon les processus de méiose et fécondation. Mais au fil du temps, inexorablement, des différences génétiques apparaissent d’une population à l’autre car ces populations connaissent des histoires

différentes, au point parfois de devenir très différentes les unes des autres. Depuis lors, les biologistes tentent de concilier la théorie de l’évolution de Darwin avec les lois de la génétique.

Qu'est-ce qu'une population à l'équilibre de Hardy-Weinberg ?

Activité 1

L'équilibre de Hardy-Weinberg

Au début du 20e siècle, le mathématicien Godfrey Hardy et le médecin Wilhem Weinberg ont découvert chacun séparément un principe qui permet de prévoir, dans certaines conditions, l’évolution des fréquences alléliques au sein des populations.

Comment évoluent les fréquences alléliques dans une population selon le principe de Hardy-Weinberg ?

Activité 1

L'équilibre de Hardy-Weinberg

1. Doc A1 - En considérant que p = 0,7 et qu’il y a panmixie, déterminer les fréquences génotypiques à la génération 2. Calculez ensuite les fréquences alléliques des allèles R et B.

2. D’après vous, les conditions de l’équilibre de Hardy-Weinberg sont-elles fréquemment réunies dans la nature ? Justifiez.

3. Doc A4 - Montrer que la structure génétique de la population est en accord avec la loi de Hardy-Weinberg. Peut-on conclure quant à la stabilité des fréquences alléliques à la vue de ces seules données ?

Ressources

documentaires

Activité 2

Les écarts à l'équilibre ou à la structure de Hardy-Weinberg

Dans les populations naturelles, de nombreux facteurs peuvent perturber la structure ou l’équilibre de HW.

Quels facteurs peuvent modifier la structure ou l’équilibre de Hardy-Weinberg ?

Activité 2

Les écarts à l'équilibre ou à la structure de HW

1. Montrez que l’équilibre de Hardy-Weinberg n’est pas atteint pour l’allèle Bar (doc. B1), pour l’allèle AceR (doc. B2) et pour l’allèle bw75 (doc. B4). Dans chacun des cas, proposez une explication.

2. Montrez par le calcul que les populations de moustiques et la population de lamiers ne possèdent pas la structure génotypique

de Hardy-Weinberg. Dans les deux cas, proposez une explication.

3. Récapitulez les résultats obtenus sous la forme d’un tableau montrant, dans chaque cas, quelle condition d’application de la structure ou de l’équilibre de Hardy-Weinberg n’est pas remplie.

Ressources

documentaires

Une population est un ensemble d’individus d’une même espèce, susceptibles de se reproduire entre eux et interagissant entre eux, à un endroit donné, et à un moment donné.

Le modèle de HW prévoit, sous certaines conditions, la stabilité des fréquences relatives des allèles dans les populations eucaryotes à reproduction sexuée :

Aide

Fiche technique Edu'modèles - module algorithmique

Fiche Technique Edu'modèles

Modéliser l’évolution des fréquences alléliques dans une population à l’équilibre de Hardy-Weinberg par un modèle algorithmique multi-agents

Exercice

Modéliser HW avec un modèle algorithmique

On considère, dans une population, un gène représenté par deux allèles notés A1 et A2.

Les génotypes possibles dans la population sont donc (A1//A1), (A1//A2) et (A2//A2).

Comment modéliser le suivi de ces deux allèles et des effectifs des génotypes possibles ?

Enfin, le modèle de HW impose de respecter certaines contraintes sur la demi-vie, la mobilité et le comportement reproducteur des agents :

Pour calculer l’évolution au cours du temps des effectifs des génotypes des différents individus, le modèle doit comporter des équations matérialisant toutes les possibilités de reproduction entre les individus. Il doit aussi tenir compte des proportions des descendants obtenus.

On se limitera par exemple à 4 descendants par reproduction, en proportions égales :

En résumé nous pouvons fabriquer un modèle qui comportera :

Modélisation

Edu'modèles

Dans notre modèle nous avons donc à créer des agents qui sont les 3 génotypes possibles dans la population et des règles de réaction entre ces agents (6 règles car 6 possibilités de rencontre entre agents) correspondant aux résultats du tableau.

Afin de ne pas perdre trop vite les agents (qui meurent au bout d’un certain temps) et de ne pas saturer l’environnement choisi (la population croît très rapidement avec 4 descendants par rencontre), il s’agit de plus de respecter les consignes suivantes :

Avec les paramètres du tableau précédent j’obtiens au cours d’une simulation l’évolution suivante :

Dans votre navigateur tapez « edumodele nice ».

Cliquez sur le premier lien Edu'modèles - Académie de Nice

Dans la fenêtre « Modèle algorithmique » cliquez sur « niveau expert ».

Vous pouvez créer le modèle en paramétrant d’abord l’environnement (100 lignes et 100 colonnes), ajouter les agents un par un (donnez une apparence et une couleur différente à chacun) puis ajouter les règles de comportement entre agents une par une.

Si vous avez des difficultés à fabriquer votre modèle, vous pouvez charger le modèle joint « completA1A2-p0,5q0,5.modele » (en haut à gauche « charger un modèle ») puis regarder comment sont codés les agents (en cliquant sur l’agent et « modifier cet agent »), pareil pour les règles.

Mise en oeuvre

Placer initialement à la main (ou automatiquement en cliquant sur l’agent puis « modifier cet agent » placement de l’agent → automatique) une vingtaine d’agents pour chacun des 3 phénotypes.

(Les agents sont déjà placés dans le modèle ci-joint).

Faire tourner le modèle au moins 1000 tours pour observer sur le graphique (que vous pouvez agrandir et récupérer) l’évolution des effectifs des génotypes. Si au départ de la simulation, certains phénotypes disparaissent, vous pouvez recommencer la simulation ou bien placer plus d’agents.

Mettre en pause à 1000 tours. Récupérer les effectifs et calculer les effectifs théoriques pour savoir si la population est à l’équilibre. Laisser ensuite tourner jusqu’à 2000 tours et recalculer.

Comment évolue la structure génotypique de la population au cours du temps ?

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