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Copy of GBS

Presnetación
by

Rodrigo Andrés Vargas Cardenas

on 5 November 2012

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Transcript of Copy of GBS

Genotyping by Sequencing (GBS) Puesta apunto de la técnica: Las información producida por el genotipado mediante diversas técnicas ha sido de gran valía, sin embargo aun tiene limitaciones. Genotipificación Distinta tasas de sustitución nucleotídica interespecifica.
Variación de intraespecífica. (Alelos nulos).
Dificultad en la lectura de los resultados.
Dificultad en la homologación de experimentos. Utilidad:
Diseñada para estudios poblacionales
Caracterización de germoplasma
Estudios de cría
Mapeo de rasgos (QTL) Disminución de la complejidad genómica con enzimas de restricción.
Utilización de códigos de barras para disminuir costos de resecuenciación y aumento de largo de tags Metodología de la técnica *Pasos Claves Elección de una enzima apropiada para el genoma a utilizar
Buena relación adaptadores-muestra NGS Illumina GBS Genotyping by Sequencing Secuenciación Illumina y Variante GBS Metodologia in silico Filtrar el grueso de datos obtenidos
Alinear las secuencias de ADN
Mapear las secuencias de ADN
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