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Variantes Genéticas do HPV 16: Filogenia e Classificação Baseadas em E6 e LCR.

Apresentação para seminário de Biologia Molecular de um artigo escolhido.
by

Agatha Bertolini

on 29 May 2013

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Transcript of Variantes Genéticas do HPV 16: Filogenia e Classificação Baseadas em E6 e LCR.

Universidade do Oeste de Santa Catarina
Curso de Biomedicina
Componente Curricular: Biologia Molecular Human Papillomavirus Type 16 Genetic Variants: Phylogeny and Classification Based on E6 and LCR. Cinthia Bertolini
Daniela Rigo São Miguel do Oeste, 28 de maio de 2013. Iris Cornet, Tarik Gheit, Silvia Franceschi, Jerome Vignat, Robert D. Burk b, Bakary S. Sylla, Massimo Tommasino, Gary M. Clifford and the HPV Study Group Variant IARC.
-Late;
-Large control region (LCR);
-Early:
-E1 e E2;
-E4;
-E5, E6 e E7. Mucosa e cutâneo Discussão Materias e Métodos DNA viral • Necessidade de uma classificação completa e padronizada. •Identificados claramente nove sublinhagens:

EUR, As, AA1, AA2, NA, AFR1a, AFR1b, AFR2a e AFR2b. •E6, apenas, não distingue as sublinhagens

- Polimorfismo A532G • LCR distingue sem determinar E6:

-Nt 7743 ao nt 25; • Uso da representação geográfica cervical da IARC. • Origem das amostras:

-IARC (vários países);

-Amostras de biópsias; Resultados - Primers:
- E6: nt 52 e nt 575
-LCR: nt 6934 e nt 114

-Produto de PCR: - E3 -> 524pb
- LCR -> 1087pb

-Sequenciamento: corante fluorescente. PCR e sequenciação de DNA Garantia de qualidade dos dados

-200 novos polimorfismos;

-Verificados no BLAST e software de rechecagem; 73% das variantes que repetiram
em pelo menos 2 amostras.

• Árvore com 4 ramos principais:

-EAS: Europa e Ásia;

-AFR1: África (1a e 1b);

-AFR2: África (2a e 2b);

-AA/NA: América do Norte e
Asiático-americano (AA1 e AA2) Uma segunda árvore foi criada com o que foi descoberto ( 353 variantes), mais o que já estava descrito na literatura. Linhagens

-Linhagem européia, asiática;

-Linhagens africanas;

-AFR1(a e b) e AFR2 (a e b);

-Linhagens norte-americana(NA) e asiática-americana (AA-1 e AA-2); Distribuição Geográfica Referências CORNET, I.; GHEIT, T.; FRANCESCHI, S.; VIGNAT, J.; BURK, R.; SYLLA, B. S.; TOMMASINO, M.; CLIFFORD, G. M.; IARC. Human Papillomavirus Type 16 Genetic Variants: Phylogeny and Classification Based on E6 and LCR. Journal of Virology. June 2012 vol. 86 .
Disponível em: <http://jvi.asm.org/content/86/12/6855.full> . FRANZ, Luciane; WEBER, Giovana R. Correlação entre a infecção por HPV e o polimorfismo (-1082) da IL-10 e o desenvolvimento de lesões neoplásicas na epiderme. Universidade do Oeste de Santa Catarina; SC, 2013.
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