Loading presentation...

Present Remotely

Send the link below via email or IM

Copy

Present to your audience

Start remote presentation

  • Invited audience members will follow you as you navigate and present
  • People invited to a presentation do not need a Prezi account
  • This link expires 10 minutes after you close the presentation
  • A maximum of 30 users can follow your presentation
  • Learn more about this feature in our knowledge base article

Do you really want to delete this prezi?

Neither you, nor the coeditors you shared it with will be able to recover it again.

DeleteCancel

Fágspecifikus gének kimutatása

No description
by

Fanny Szumutku

on 16 April 2015

Comments (0)

Please log in to add your comment.

Report abuse

Transcript of Fágspecifikus gének kimutatása

vízvirágzás
cianotoxin
cianofág
MODELLRENDSZER
Fágspecifikus gének kimutatása toxinkezelt cianofág-gazdasejt rendszerekben
cianobaktérium
növekedés nyomon
követése

fehérje összetétel és
DNS mintázat meghatározása

Anyag és módszer 1.

Synechococcus sp.
PCC 6301 törzs
módosított Allen mediumban
5% CO2-t tartalmazó, sterilre szűrt levegővel buborékoltatott tenyészet
39 ºC-os vízfürdő
200 μE m s fényerősség


AS-1 cianofág
differenciál centrifugálással koncentrált és tisztított AS-1 lizátum
plakk képző egység (PFU) meghatározása
1x multiplicitás alkalmazása


mikrocisztin-LR


Anyag és módszer 2.
Fágfertőzött és gazdasejtek DNS mintázatának meghatározása
-nukleinsav koncentrálása PEG8000-rel
-nukleinsav kivonása fenolos módszerrel
-elválasztás gélelektroforézissel
-ezüstfestés
-kiértékelés: GelAnalyzer 2010 programmal
Eredmények és értékelésük
3.ábra. A CL cyanomyovirus primer alkalmazása fáglizátumból származó DNS minták amplifikálása során.
Eredmények és értékelésük
2.ábra. A
gp20
gén átfedő régióinak amplifikálása különböző primerkombinációkkal gazdasejtekből és fáglizátumból származó DNS mintákban.
Eredmények és értékelésük
1.ábra. A
gp20
gén átfedő régióinak amplifikálása különböző primer kombinációkkal gazdasejtekből és fáglizátumból származó DNS mintákban
cilindrospermopszin
1. CSOPORT
-
gp20
gén:
-CPS primerkombinációk:
CPS1-2: 165 bp hosszúságú amplifikált régió
CPS 1-4: 430 bp hosszúságú amplifikált régió
CPS 1-8: 592 bp hosszúságú amplifikált régió
-
gp23
gén
:
480 bp hosszúságú szakasz
MZ1Abis és MZ1A6 primerek

2. CSOPORT
-CL cyanomyovirus primer: 359 bp hosszúságú régió
-FGL cyanomyovirus primer: 317 bp hosszúságú régió

Anyag és módszer 3.
Fágfertőzött és gazdasejtek DNS mintázatának meghatározása
GAZDASZERVEZET
CIANOFÁG
CIANOTOXIN
Konklúzió
A fágciklus
-cianofág-cianobaktérium-cianotoxin modellrendszer vizsgálata
-fágspecifikus primerek vizsgálata


1.adszorpció
2.integrálódás
3. átírás
4. sokszorozódás
5. lízis
-2
-1
Továbblépés
-AS1 fágspecifikus gének azonosítása toxinkezelt rendszerben
-fágciklus korai szakaszából vett minták amplifikálása
-génexpresszió vizsgálata toxinkezelt rendszerben
Irodalomjegyzék
Wommack, K. E., and R. R. Colwell.2000. Virioplankton: viruses in aquatic ecosystems. Microbiol. Mol. Biol. Rev.64:69–114.

Yoshida, T., Y. Takashima, Y. Tomaru, Y. Shirai, Y. Takao, S. Hiroishi, and K. Nagasaki.2006. Isolation and characterization of a cyanophage infecting the toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. Appl. Environ. Microbiol. 72:1239–1247.

Suttle, C. A.2000. Cyanophage and their role in the ecology of cyanobacteria, p. 563–589.

Chorus, I., Bartam, J.: (1999) Toxic cyanobacteria in water – A guide to their public health consequences, monitoring and management. E FN Spon London
Köszönetnyilvánítás
DE TTK BÖI

Dr. Surányi Gyula

Kisvárdai Bessenyei György Gimnázium és Kollégium

Tóth Szilvia
Dr. Jámbrik Katalin
Dr. Koncz Gábor


Eutrofizáció
specifikus
ismert funkciójú gén
primere:

CPS
fágfertőzéssel kapcsolatban lévő gén
primere: CL cyanomyovirus
mentor: Dr. Surányi Gyula
készítette: Szumutku Fanni
Full transcript