Loading presentation...

Present Remotely

Send the link below via email or IM

Copy

Present to your audience

Start remote presentation

  • Invited audience members will follow you as you navigate and present
  • People invited to a presentation do not need a Prezi account
  • This link expires 10 minutes after you close the presentation
  • A maximum of 30 users can follow your presentation
  • Learn more about this feature in our knowledge base article

Do you really want to delete this prezi?

Neither you, nor the coeditors you shared it with will be able to recover it again.

DeleteCancel

Make your likes visible on Facebook?

Connect your Facebook account to Prezi and let your likes appear on your timeline.
You can change this under Settings & Account at any time.

No, thanks

ESTRUCTURA GENETICA POBLACIONAL Y FILOGEOGRAFIA DE Rhinopter

No description
by

Paola Palacios

on 19 June 2014

Comments (0)

Please log in to add your comment.

Report abuse

Transcript of ESTRUCTURA GENETICA POBLACIONAL Y FILOGEOGRAFIA DE Rhinopter

INTRODUCIÓN
VARIABILIDAD GENÉTICA POBLACIONAL Y FILOGEOGRAFÍA DEL GÉNERO Rhinoptera

(ELASMOBRANCHII, MYLIOBATIFORMES) EN EL ATLANTICO OCCIDENTAL

Batoidea
La especiación es uno de los procesos evolutivos más importantes
ANTECEDENTES
OBJETIVOS
Habitan los océanos desde hace más de 400 millones de años

Adaptandose a todo tipo de hábitats marinos y estrategias de vida

Clase Chondricthyes
Subclase Elasmobranchii
Cohorte Euselachii
Sub cohorte Neoselachii
Súper orden Batoidea

Pikitch et al., 2008, Mejía-Falla et al., 2007

Aproximadamente 160 especies
Compagno, 1999; Nelson, 1994; Neer y Thompson, 2005
en aguas templadas y tropicales de todo el mundo
Familia Rhinopteridae
8 especies
habitan bahías, estuarios y desembocaduras de ríos
género Rhinoptera
VULNERABLES
•Lento crecimiento
•Madurez sexual tardía
•Largos períodos de gestación
•Poca descendencia
“BAJO POTENCIAL REPRODUCTIVO Y DE REPOBLACIÓN”

SENSIBLES A LA SOBREPESCA!
Bonfil, 1994; Musick et al., 2000; Musick, 2005

Filogenia molecular: herramienta fundamental en el establecimiento de comprender el proceso y las rutas evolutivas de los eventos de especiación
Filogeografía: análisis espacial de los linajes génicos.
se aplica a niveles infraespecífico o de especies cercanamente emparentadas y enfatiza los aspectos históricos de la actual distribución de los linajes génicos
Avise et al., 1987
Rhinoptera bonasus
NADH2
Cyt b
COI
16S
12S
RAG1
McVeigh,D.M., Carney,S.L., Morrissey,J.F. and Ferrier,D.M. 2012.
*Genetic Analysis of Populations of the Cownose Ray, Rhinoptera bonasus, in the Chesapeake Bay and Florida Coast.

(NADH2, Cyt b, COI, 16S, 12S)

Horman,S.R., Frank,M. and Luning-Prak,N. 2005.
A Two Hit Transposon Model for the Origin of Immunoglobulin Gene Rearrangement.
(RAG1)

Bade,L.M., Pilgrim,E.M., Balakrishnan,C.N., McRae,S.B. a Luczkovich,J.J. 2013.
Use of genetic techniques to identify the diet of cownose rays, Rhinoptera bonasus, in North Carolina and Virginia: an analysis shellfish prey items.

(COI)
Rhinoptera brasiliensis
COI
Ribeiro,A.D.E.O., Oliveira,C. and Ribeiro,A.D. (2012).
Molecular identification of Brazilian marine fishes through DNA barcodes
Rhinoptera steindachneri
NADH2
Cyt b
RAG1
Sandoval-Castillo,J. and Rocha-Olivares,A. (2011)
Deep mitochondrial divergence in Baja California populations of a aquilopelagic elasmobranch: the golden cownose ray.

(NADH2)

Aschliman,N.C. (2011)
The Batoid tree of life: recovering the patterns and timing of the evolution of skates, rays and allies (Chondrichthyes: Batoidea).
Aschliman,N.C., Nishida,M., Miya,M., Inoue,J.G., Rosana,K.M. and Naylor,G.J.(2012).
Body plan convergence in the evolution of skates and rays (Chondrichthyes: Batoidea)
(RAG1)

Martin,A.P., Lovejoy,N. and Bermingham,E. (1998)
Marine incursion into South America.
(Cytb)

ADNmt
citocromo oxidasa I (
COI
)
citocromo b (
Cytb
)
adenina nitotinamide deshidrogenasa subunidad 2 (
NADH2
)

ADNn
gen activador de recombinación 1, (
RAG1
)
La Filogeografía ha mejorado mucho la descripción de la distribución geográfica, las relaciones filogenéticas y distancias genéticas entre linajes, logrando tener una mejor comprensión de la biogeografía regional y áreas de endemismo.
Corresponden las subdivisiones genéticas y su distribucion geográfica con las subespecies morfológicas actuales de
R. brasiliensi
s a lo largo de las zonas costeras de Brasil y el Golfo de México (es decir, ¿existen restricciones en la dispersión entre las ubicaciones?
Si las poblaciones de
R. brasiliensis
del Atlántico sur occidental son distintas a las poblaciones del Golfo de México, ¿Podemos entonces determinar si las diferencias genéticas entre los sitios se explican por la distancia en relación a una capacidad de dispersión limitada o si otros factores tales como la preferencia de hábitat o la fidelidad a sitios de crianza o reproducción juegan un papel preponderante?
• Evaluar el nivel de variabilidad genética del género Rhinoptera a lo largo de su distribución en el Océano Atlántico Occidental, empleando marcadores moleculares y definir si esta corresponde a algún patrón filogeográfico.
Específicos

Estimar la diversidad nucleotídica y haplotípica de
Rhinoptera bonasus
y
R. brasiliensis.
Obtener estimaciones de divergencia poblacional, que nos permitan inferir si existe relacion entre
Rhinoptera bonasus
,
R. brasiliensis
y
R. steindachneri
.
Determinar la existencia del flujo genético entre las poblaciones y localidades.
Establecer la correlación entre las distancias genéticas y las distancias geográficas.
Establecer la historia demográfica y filogeográfica de
Rhinoptera bonasus,

R. brasiliensis
y
R. steindachneri
.

La aproximación al conocimiento del genero Rhinoptera desde la genética de poblaciones y la filogeografia se hace imprescindible para ocntribuir a la elaboración de un marco de referencia con la posibilidad de inferir la variabilidad genética de las poblaciones, de estimar los tamaños poblacionales, tamaños efectivos y los tiempos de divergencia, establecer el número de acervos genéticos mas probables de la población, su ubicación geográfica y la correspondencia entre las subdivisiones poblacionales taxonómicas establecidas morfológicamente y las encontradas a nivel genético, para la resolución de incertidumbres taxonómicas, entre otros.
MÉTODOS
Variacion inter e intrapoblacional
Relaciones filogeneticas
CLUSTALX
diversidad haplotipica (H)
diversidad nucleotidica (π)
número de sitios polimorficos (S)
divergencia genetica media entre y dentro de poblaciones
modelo de evolucion de secuencia Kimura 2-parametros calculando los valores de ΦST (analogo de Fst) por pares, teniendo en cuenta la variacion de las frecuencias haplotipicas entre poblaciones y la distancia genetica.
Analisis de Vecino mas Proximo (Neighbour-Joining, NJ)
Maxima Parsimonia (Maximum Parsimony, MP)
Maxima Verosimilitud (Maximumlikelihood, ML)
Bayesiano (Bayesian inference, BI)
Historia demografica
Distribucion de frecuencias por pares de secuencias (distribucion Mismatch) dentro de las poblaciones mediante una aproximacion de minimos cuadrados

expansion de las poblaciones, Fu y Li’s D* y Tajima’s D calculados con el programa DnaSP
Full transcript